Cradle - 科学家专用的AI驱动蛋白质工程平台

什么是 Cradle

蛋白质工程长期面临着一个核心挑战：传统研发模式依赖大量湿实验筛选，周期长、成本高、效率低。一位科学家可能需要花费数月甚至数年，通过一轮又一轮的实验才能找到性能优良的蛋白质候选物。这种“试错式”研发不仅耗时耗力，还常常因为后期出现的可开发性问题导致整个项目失败。

Cradle 正是为解决这一痛点而生的 AI 驱动蛋白质工程平台。它将机器学习与您的湿实验数据深度结合，让科学家能够在更少的实验中实现更多突破。简单来说，Cradle 不是替代您的实验，而是帮助您更聪明地设计实验——通过 AI 预测哪些突变最有可能成功，大幅减少需要验证的候选物数量。

目前，Cradle 已帮助超过 50 个项目实现了 2 到 12 倍 的研发加速。全球知名企业包括 Novo Nordisk、Novonesis、Bayer、argenx、AbbVie、Johnson & Johnson、Immunai 和 Pfizer 都在使用 Cradle 进行蛋白质优化。科学家们对 Cradle AI 设计的蛋白质候选物平均给出 8/10 的评分，这充分证明了平台的实际价值。

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Cradle 的核心功能

多属性协同优化

您是否遇到过这样的情况：优化了蛋白质的活性，却发现它的稳定性下降了？这种“按下葫芦浮起瓢”的困境在传统研发中极为常见。Cradle 的多属性优化引擎能够同时优化多个属性——活性、稳定性、表达量、结合特异性、免疫原性等，在单轮设计中实现目标的平衡。这意味着您不必在不同属性之间做痛苦的取舍，而是可以获得一个在各方面都达到要求的候选物。

自动化模型微调

每个蛋白质项目都是独特的，通用模型虽然可用，但针对您特定项目的定制模型效果会更好。Cradle 的自动化模型微调功能能够自动使用公共数据、专有湿实验数据和客户特定数据构建定制模型。您只需要上传实验结果，平台就会据此优化模型。随着您的实验数据积累越多，模型对您项目的理解就越深入，预测准确性也会持续提升。

智能实验板设计

这是 Cradle 最受欢迎的功能之一。当平台生成数百万个候选序列后，您不需要逐一测试——那既不现实也不经济。智能实验板设计通过数千次虚拟模拟，从海量候选物中精选出最有可能成功的序列组合，最大化您的实验成功率。这样一来，您只需要合成和测试几十个候选物，就能找到理想的结果。

高级序列设计控制

有时候，您需要对 AI 的设计进行精确控制。Cradle 支持模板序列、阻断突变、区域约束、自定义优化目标等功能，让您能够精确控制突变的位置和类型。比如，您已知某个结构域对功能至关重要，不希望被修改，或者需要避免某些特定的基序，这些都可以通过高级控制实现。

数据与工作流管理

研发数据是企业的核心资产。Cradle 提供灵活的数据管理、自定义 schema、完整溯源追踪，确保您的实验数据有序存储，随时可查。同时，完整的 API 访问支持让您能够将 Cradle 集成到现有的实验室信息管理系统（LIMS）或研发平台中，实现自动化工作流。

企业级安全

对于生物制药企业来说，数据安全关乎生死。Cradle 提供 SOC 2 Type II 认证，支持 SSO（Google、Microsoft）、MFA 多因素认证、Passkeys，以及基于角色的权限控制，满足企业级的安全要求。

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谁在使用 Cradle

生物制药：抗体药物发现

假如您是一名抗体药物研发科学家，您一定清楚传统抗体发现依赖大规模筛选的痛点——从动物免疫到杂交瘤筛选，流程漫长且充满不确定性。使用 Cradle，您可以从单序列或现有数据集启动，AI 会生成经过优化的候选物。更重要的是，平台在进行亲和力成熟的同时，会自动考虑可开发性因素，帮助您避开免疫原性等后期风险。这样既能加速早期发现，又能提高后续开发的成功率。

酶工程：工业酶优化

工业酶常常需要在极端条件下工作——高温、强酸强碱、有机溶剂环境等。使用 Cradle 的多属性优化能力，您可以同时平衡催化活性与热稳定性，让酶在挑战性条件下依然保持高效催化。这对于工业生物技术公司来说，意味着更低的能耗和更高的产率，直接转化为成本优势。

疫苗研发：抗原设计

疫苗抗原的稳定性直接影响免疫原性和生产成本。通过 Cradle 优化抗原的稳定性和免疫原性，您可以更快达到治疗目标，加速疫苗研发进程。

多特异性抗体开发

双特异性抗体、多特异性抗体是当前抗体药物的热门方向，但开发难度也更高——您需要平衡多个结合位点的性能。Cradle 支持 VHH、scFv、Fab、IgG、双特异性等多种抗体格式，帮助您同时优化多个结合位点的亲和力和特异性。

蛋白质可开发性优化

许多候选物在早期表现优异，却在后期开发中因可开发性问题失败——免疫原性、聚集倾向、翻译后修饰位点等都可能导致前功尽弃。Cradle 能在早期就识别和规避这些风险，显著降低临床失败的可能性。

工业生物酶与从头设计

即使您没有任何历史数据，Cradle 也能帮助您启动项目。从单序列出发，AI 会引导生成新候选物，让全新蛋白质设计成为可能。

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技术架构与特性

基础设施与性能

Cradle 基于 Google Cloud Platform（欧洲数据中心）构建，数据存储于荷兰的 europe-west4 区域，并自动复制到其他欧盟区域实现冗余备份。平台每两周更新一次 AI 模型，确保您始终能够使用最新的技术能力。

核心技术能力

• 多属性优化引擎：支持优化任何可测量的蛋白质属性，无论您关注的是活性、稳定性、表达量还是特异性，平台都能处理
• 模块化任务系统：可以并行运行多个训练和生成配置，大幅提升研发效率
• 湿实验验证：Cradle 在阿姆斯特丹设有自有湿实验室，持续验证和优化平台 AI 能力，确保模型“开箱即用”
• 全工作流 API 支持：从序列设计到实验板规划，从数据分析到结果汇总，您可以通过 API 实现全流程自动化
• 零维护基础设施：Cradle 是完全托管的 AI 平台，您无需管理任何硬件或模型训练基础设施，可以将全部精力投入到科学研究中

技术差异化

与传统的基于规则的工程方法不同，Cradle 的 AI 模型能够从数据中学习蛋白质序列与功能之间的关系，发现人类难以直觉到的规律。这种数据驱动的方法在面对复杂的多属性优化问题时，优势尤为明显。

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安全与合规

在生物制药行业，数据安全和知识产权保护是选择供应商的首要考量。Cradle 在这方面为您提供全方位的保障。

数据安全

• 存储位置：所有数据存储于荷兰（europe-west4）的 Google Cloud 数据中心，冗余备份确保数据安全
• 加密标准：静态数据采用 AES-256 加密，传输数据采用 TLS 1.2+ 加密
• 访问控制：支持 MFA 多因素认证、Passkeys，以及 SSO（Google、Microsoft）登录

知识产权保护

• 数据隔离：客户数据仅用于训练该客户的模型，永不共享，实现完全的逻辑隔离
• IP 所有权：客户保留全部 IP 所有权，Cradle 不收取任何版税
• 合规认证：获得 SOC 2 Type II 认证，完全符合 GDPR 要求

企业级支持

Cradle 支持 SAML/OIDC 单点登录，基于角色的权限控制（RBAC）让您能够精细管理不同团队成员的访问权限，满足大型企业的合规需求。

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常见问题

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如果您想了解 Cradle 是否适合您的团队，建议从预约产品演示开始。我们的团队会根据您的具体项目需求，评估平台如何帮助您加速研发进程。